Многообещающего нападающего Робби Фаулера в резерв Ливерпуля привлек сам «король» Кенни Далглиш в 1991 году. Однако дебютировал он уже при Грэмме Саунессе. Юный Фаулер приобрел известность летом 1993 года на турнире команд до 19 лет, где успешно выступал за сборную Англии.

Ливерпуль на старте сезона 1993/94 испытывал кризис в атаке, в результате чего 18-летний нападающий был привлечен в основной состав. Дебют форварда состоялся в матче розыгрыша кубка Лиги против лондонского Фулхэма, в котором Фаулер забил свой первый гол за Ливерпуль. Через пару игр, он забил тому же Фулхэму сразу пять мячей, установив рекорд. Первое выступление Фаулера в премьер-лиге было также ознаменовано голом в ворота Олдхэма. В конце октября он праздновал свой первый хет-трик в матче с Саутгемптоном на Энфилде. Сезон молодой форвард закончил с 18 голами, при этом пропустив пару месяцев из-за травмы.

В сезоне 1994/95 Ливерпуль возглавил Рой Эванс, а Фаулер и Ян Раш составили в его команде атакующий дуэт. Набираясь опыта у старшего партнера, которого безмерно уважал, Робби Фаулер провел очень приличный сезон. Он установил рекорд скорострельности, сделав хет-трик за 4 минуты в ворота Арсенала. В апреле 1995 года выиграл в составе мерсисайдского клуба кубок английской Лиги. Его сезонный показатель составил 31 гол.

В сезоне 1995/96 Ливерпуль приобрел у Ноттингем Форест нападающего Стэна Коллимора, который поначалу играл в паре с Рашем. В результате Фаулер попал на скамейку запасных. Однако конкуренция за место в основе подействовала на форварда благотворно, поэтому, когда травму получил Коллимор, у Роя Эванса не болела голова, кем его заменить. Фаулер провел четыре гола в ворота Болтона, сделал хет-трик в матче с Арсеналом, забил четыре мяча в двух играх с Манчестер Юнайтед. За вышеназванные «подвиги» получил у партнеров и фанатов прозвище «Бог». В конце сезона на счету Коллимора и Фаулера было 55 голов, из которых последний провел 36. Английский чемпионат, правда, в то время славился бомбардирами, поэтому высокий результат Фаулера оказался все-таки пониже, чем у Алана Ширера.

Молодой нападающий был включен в заявку сборной Англии на Евро-96, однако он сыграл очень мало и ничем не запомнился.

Сезон 1996/97 начался для Фаулера с травмы, а потому ознаменовался некоторой потерей результативности. Затем последовали и хет-трики, и покер. В матче против Миддлсбро форвард провел свой 100-й гол за Ливерпуль. На тот момент Фаулеру был 21 год. Его результаты очень впечатляли. Мерсисайдский клуб в том сезоне дошел до полуфинала Кубка обладателей кубков. Фаулер с 7 голами стал лучшим бомбардиром турнира, обскакав по этому показателю самого Рональдо, хотя именно его Барселоне и достался Кубок. Сезон Фаулер закончил досрочно, так как был удален во время мерсисайдского дерби за потасовку с защитником Эвертона и получил дисквалификацию на 3 оставшихся матча. Его Ливерпулю это стоило места в Лиге чемпионов.

Сезон 1997/98 сложился для Фаулера ужасно. Летом он перенес операцию на носу. Затем получил травму в предсезонном товарищеском матче Ливерпуля против сборной Норвегии. Правда, за те 30 минут, что он пробыл на поле, забил 2 гола. В итоге Фаулер появился в составе Ливерпуля к середине сентября. Однако обнаружил, что его место занято «новым Робби Фаулером» – 17-летним Майклом Оуэном. Правда, в запасе Фаулер не остался. Питающий к нему чувства, сродни отцовским, Рой Эванс попеременно использовал в атаке дуэты Фаулер-Ридле или Фаулер-Оуэн, причем первый поначалу выглядел гораздо эффективнее. 1 ноября во встрече с Болтоном Фаулер снова получил красную карточку, а, отбыв дисквалификацию, казалось, забыл путь к чужим воротам. Одновременно это совпало с большим взлетом Майкла Оуэна. Газеты в этот неприятный для нашего героя период жизни наперебой сообщали, что Фаулер требует у Ливерпуля увеличения заработной платы, принимает наркотики и жестоко завидует Оуэну. Правды в этом практически не было.

В сборную Фаулера уже не вызывали. После безголевой серии он наконец-то забил гол в полуфинале кубка английской Лиги в ворота Миддлсбро. Этот мяч стал для него последним в сезоне. 23 февраля на последних минутах мерсисайдского дерби Фаулер получил тяжелую травму после столкновения с вратарем Эвертона. По предсказанию медиков, его восстановление намечалось на январь 1999 года. Чемпионат мира 1998 года во Франции Робби Фаулер наблюдал по телевизору.

Однако в сентябре 1998 года Фаулер уже снова играл за Ливерпуль. Все его достижения к тому времени были забыты, а на Энфилде правил бал герой чемпионата мира Майкл Оуэн. В ноябре Фаулер провел хет-трик в ворота Астон Виллы. Тем не менее, подвергался постоянной критике за слабую игру, хотя еще не полностью восстановился после травмы. В матче против Саутгемптона, выигранном Ливерпулем со счетом 7:1 сделал 9-й хет-трик в своей карьере и преодолел рубеж в 100 мячей в премьер-лиге.

В рядах болельщиков «Ливерпуля» существует мнение, что именно Фаулера не хватило их команде, чтобы завоевать чемпионский титул в сезоне 2001—2002 и последующих. Пять лет он провел в клубах «Лидс Юнайтед» и «Манчестер Сити», а в январе 2006 года вернулся в родную команду.

Вместе с «Ливерпулем» Фаулер дошёл до финала Лиги Чемпионов 2007 года, в котором его клуб уступил итальянскому «Милану» со счётом 1—2. 1 июля 2007 года Фаулер стал свободным агентом и позднее присоединился к «Кардифф Сити». Однако старые травмы не позволили ему заиграть в полную силу. 17 января 2008 года стало известно, что Робби пропустит остаток сезона из-за того, что беспокоившие его повреждения оказались серьёзнее, чем все думали. Несмотря на то, что его контракт с клубом истекал летом 2008 года, ожидалось, что соглашение будет продлено ещё на год, футболист даже успел согласовать условия личного контракта. Тем не менее, 11 июля 2008 года было объявлено о переходе Фаулера в клуб английской Премьер-лиги «Блэкберн Роверс», контракт заключён сроком на один год

Последней командой которого был "Блэкберн", подписал контракт с австралийским клубом "Норт Квинсленд Фури".